植物生理學實驗課程以配合正課教學內容和具體化教科書上的學理為教學目標，內容可分成六大主題，每個主題包含多個實驗課程；
I、水份輸送：利用簡單的實驗方法及儀器輔助測定植物中水勢大小及蒸散作用速率，了解水分在植物體中吸收、運送、蒸散的原理及意義。
II、營養元素的吸收與功能：觀察植物生長發育對特定營養元素的需求及缺乏時所引發的病癥，並藉由根瘤菌之接種了解植物界的共生現象，更進一步學習定量leghemoglobin蛋白質及利用氣相層析儀分析根瘤中固氮酵素的活性，探討外在元素之供應對植物與微生物之共生作用及固N2活性的影響。
III、植物色素與光合作用：學習利用離心法分離葉綠體，並進行光合作用速率的測定；利用分光光度計分析多種色素的吸收光譜，比較光合色素和花青素的吸收光譜，並了解其扮演的不同生理功能。
IV、有機分子抽取及分析：學生將練習抽取植物體中之醣類、酵素、蛋白質等有機分子，進行初步的定量及定性分析，並學習蛋白質電泳分分析技術、利用電腦程式計算及分析結果。
V、植物荷爾蒙功能檢定：探討多種植物荷爾蒙的專一性及交互性生理功能，並學習利用無菌培養技術以進行植物分化全能性之實驗。
VI、植物逆境生理反應：研究環境逆境對植物所引發的抵抗機制，並利用生物染色法檢試細胞活性及以離子測定儀測量細胞膜滲漏情形，瞭解生物受傷害時所發生的基本生理變化。